玻璃钢化粪池在运行前，均应进行检查和清洁两项前期工作。其运行部分更应详细检查，待无问题后方可进行。下列所示为需检查的各方面：
通过检查门进入塔内，清理底盆上的杂物和淤泥，检查管道是否淤塞。用高压水洗涤散热胶片及底盆之泥土，并通过排水口将污水排出。
检查马达接线是否正确、牢靠、马达接线盒是否盖紧，重庆化粪池/生化池以免水气渗入。检查皮带传动装置中的皮带松紧度，使之在8~15mm之间。检查风机转动是否灵活顺畅，各风扇叶片尾与水塔外壳是否间隙均匀。
检查浮阀组合件是否装妥。检查各层胶片的数量和疏密程度是否合适。检查玻璃钢化粪池所有螺栓是否已拧紧。
水位调校：将玻璃钢化粪池水盆和水管先充水至运行水位，浮阀组合也调至运行水位，保证水泵开启后底盆之水位仍处于运行水位高度，即在溢水口以下20mm之位置。
接通马达开关，从水塔顶部往下观察风扇应按顺时针方向旋转，气流向外抽出。启动循环水系统，检查此时的运行电流，其电流值不超过电动机铭牌所示额定电流的百分之九十五。
水泵运行后，进水通过耗能缸进入到播水盆，由分布在播水盆上的大小淋水孔进行淋水，要求淋水均匀、细密。